COX单因素分析显示,临床分期、肝硬化、包膜侵犯、远处转移、PCDH8基因甲基化阳性、RIZ1基因甲基化阳性是肝癌患者总生存时间的

COX单因素分析显示,临床分期、肝硬化、包膜侵犯、远处转移、PCDH8基因甲基化阳性、RIZ1基因甲基化阳性是肝癌患者总生存时间的影响因素(P<0.05);多因素分析显示,矫正其他因素后,PCDH8基因甲基化阳性是肝癌总生存时间的独立影响因素(P<0.05)。结论肝癌组织PCDH8、RIZ1基因甲基化状态与肿瘤发生、发展及预后相关,临床可考虑将基因甲基化状态辅助用于肝癌诊CH5424802断、病情评估及预后预测中。
植物受到干旱胁迫时,会通过DNA甲基化做出快速反应以帮助其应对胁迫。为探究在干旱胁迫下,DNA甲基化是如何影响基因转录表达,本研究对甘露醇模拟干旱和5-azadC (去甲基化)处理下,抗旱性不同的2个马铃薯品种(抗旱型,青薯9号;干旱敏感型,大西洋)进行转录组学分析,以Fold-change > 2和校正后Pselleck PI3K Inhibitor Library < 0.01进行差异表达基因(DEG)的筛选。GO富集分析发现,2种处理都共同显著富集到氧化应激和碳水化合物代谢过程相关的GO term。说明不同耐旱性马铃薯在响应干旱胁迫时,与这些GO term相关的基因也受DNA去甲基化调控。对既响应干旱又响应DNA去甲基化的1345个DEGs进行KEGG功能富集发现,与植物抗旱相关的通路有植物MAPK信号查找更多途径、植物激素信号转导途径、植物谷胱甘肽代谢通路、糖酵解与糖异生和磷酸肌醇代谢通路。说明这些通路相关基因在大西洋和青薯9号2个抗旱性不同的马铃薯品种中,响应干旱的敏感性受DNA甲基化调控。接着对DEGs上游1500 bp启动子区域进行顺式作用原件和甲基化CpG岛分析发现,干旱胁迫下参与植物谷胱甘肽代谢的GST基因通过DNA去甲基化来降低启动子区ABRE和CAAT-box作用元件的甲基化水平,进而激活该基因的表达以应对干旱胁迫。

Comments are closed.